Nowe strony
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
- 22:02, 30 sty 2023 Niemiecki/Gramatyka/Tabela-Czasowniki (hist. | edytuj) [2921 bajtów] EdytaT (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "<noinclude> {{OzdobnaNawigacja| Podrecznik= Język niemiecki| PoprzStrona='''Gramatyka'''| ObecnaStrona=Tabela czasowników nieregularnych i mocnych| NastStrona='''Gramatyka'''| }} {{UnikatowaStronaStart}}</noinclude> = Tabela czasowników nieregularnych i mocnych = == Czasowniki nieregularne == == Czasowniki mocne == {| class="wikitable" |- |[http://pl.wiktiona…")
- 11:33, 29 sty 2023 Niemiecki/Exc/Imperfekt (hist. | edytuj) [3284 bajty] EdytaT (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "== Übugen - Präteritum (Imperfekt) == <quiz display=simple> { |type="{}"} '''Ergänze die Verbformen in Imperfekt (Präteritum)'''<br> lernen { lernte } machen { malte } machen { machte } machen { malte } </quiz> <noinclude> {{Nawigacja|../| ../Niemiecki/Exc/| ../Niemiecki/Exc/}} {{Wolumin}} </noinclude>") oryginalnie utworzono jako "Niemiecki/Exc/Verben/Verbformen/Impferfekt"
- 11:24, 29 sty 2023 Niemiecki/Exc (hist. | edytuj) [2834 bajty] EdytaT (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "== Übungen == * Impferfekt * Perfekt")
- 13:04, 28 sty 2023 Niemiecki/Gramatyka/Czasy/Ćwiczenia (hist. | edytuj) [1294 bajty] EdytaT (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "== ''Ergänze die Verben in der richtigen Form!'' == <quiz display=simple> { |type="{}"} ''Präsens'' Eva ''wohnt'' in Berlin.<br> ''Präteritum: Eva ... in Berlin. { wohnte } { |type="{}"} Wstaw czasownik "sprechen" dla zdania: Er ... Englisch und Spanisch. { spricht } { |type="{}"} Wstaw czasownik "haben" dla zdania: ... du Haustiere? { Hast } { |type="{}"} Wstaw czasownik "wohnen" dla zdania: Peter ... in Deutschland. { wohnt } { |type="{}"} Wstaw…")
- 19:32, 27 sty 2023 Muzyka/Klucze (hist. | edytuj) [1159 bajtów] EdytaT (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "== Klucze == '''Klucz''' umieszczony na początku pięciolinii przyporządkowuje liniom (i polom) poszczególne wysokości dźwięków. Do najczęściej stosowanych kluczy należą klucz wiolinowy i basowy. '''Klucz wiolinowy''', zwany także kluczem G, wskazuje, że na drugiej linii (licząc od dołu) znajduje się nuta g', czyli ''sol'' (więcej o nazwach nut w następnym rozdziale). <score> \relative g'{ g } </score> '''Klucz basowy''…")
- 15:17, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/całość (hist. | edytuj) [470 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart}} {{../Strona_tytułowa}} {{../Oświadczenie_autora_i_promotora}} {{../Streszczenie}} {{../Spis_treści}} {{../Podziękowania}} {{../Wstęp}} {{../Wstęp/Budowa_wirionów_bakteriofagów_z_rzędu_Caudovirales}} {{../Wstęp/Modularna_struktura_genomów_bakteriofagów}} {{../Wstęp/Opis_cyklu_infekcyjnego_bakteriofagów_z_rzędu_Caudovirales}} {{../Wstęp/Cykl_lizogenny,_stan_pseudolizogenii,_infekcja_chroniczna}} {{../Wstęp/Analiza_bioinformatyczna…")
- 14:59, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wyniki i dyskusja (hist. | edytuj) [1352 bajty] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="5" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''5. Wyniki i dyskusja'''}}<section end="5" /> {{:Wstępna_charakterystyka_bakteriofaga_Serratia_φOS10/Wyniki_i_dyskusja/Uzyskanie_czystych_kultur_fagowych_z_próbki_środowiskowej_metodą_szalek_dwuwarstwowych_i_określenie_ich_morfologii}} {{:Wstępna_charakterystyka_bakteriofaga_Serratia_φOS10/Wyniki_i_dyskusja/Analiza_re…")
- 14:51, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wyniki i dyskusja/Weryfikacja zdolności do wejścia w stan lizogenii φOS10 (hist. | edytuj) [3066 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="5.5" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''5.5 Weryfikacja zdolności do wejścia w stan lizogenii φOS10'''}} {{tab|40}}W celu ustalenia czy φOS10 jest fagiem łagodnym, a zatem czy ma zdolność wejścia w stan lizogenii, podjęto próbę uzyskania lizogena. Jako gospodarza wybrano szczep ''Serratia'' sp…")
- 14:48, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wyniki i dyskusja/Uzyskanie czystych kultur fagowych z próbki środowiskowej metodą szalek dwuwarstwowych i określenie ich morfologii (hist. | edytuj) [2647 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="5.1" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''5.1 Uzyskanie czystych kultur fagowych z próbki środowiskowej metodą szalek dwuwarstwowych i określenie ich morfologii'''}} {{tab|40}}W celu uzyskania pojedynczych łysinek stosowano metodę szalek dwu…")
- 14:45, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wyniki i dyskusja/Proponowane kierunki dalszych badań (hist. | edytuj) [1238 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="5.8" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''5.8 Proponowane kierunki dalszych badań'''}} {{tab|40}}Czynności opisane w niniejszej pracy stanowią wstępny etap badań. W ramach następnych kroków można by przeprowadzić: *analizę morfologii wirionów z użyciem transmisyjnej mikroskopii elektronowej, co pozwoli określić pa…")
- 14:43, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wyniki i dyskusja/Określenie sekwencji cos (hist. | edytuj) [5390 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section end="5.4" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''5.4 Określenie sekwencji ''cos'''''}} {{tab|40}}Podczas analizy wyników sekwencjonowania zaobserwowano, że kontig zawierał na początku i na końcu tą samą sekwencję {{#tag: span|GCGCGCAATGCC|class=s78r}} (Rycina 21), co mogło być sekwencją cos odczytaną dla obu końców genomu niezależn…")
- 14:38, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wyniki i dyskusja/Badanie kinetyki adsorpcji bakteriofaga φOS10 do gospodarza (hist. | edytuj) [4632 bajty] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="5.6" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''5.6 Badanie kinetyki adsorpcji bakteriofaga φOS10 do gospodarza'''}} {{tab|40}}Badanie wykonano zgodnie z opisem przedstawionym w Podrozdziale 4.18. Uśrednione wartości adsorpcji w zależności od czasu prezentuje Tabela 11. Wyniki opracowane w programie Libre…")
- 14:33, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wyniki i dyskusja/Badanie jednego etapu replikacji (ang. One-Step Growth) faga φOS10 (hist. | edytuj) [757 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="5.7" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''5.7 Badanie jednego etapu replikacji (ang. One-Step Growth) faga φOS10'''}}<section begin="5.7" /> {{:Wstępna_charakterystyka_bakteriofaga_Serratia_φOS10/Wyniki_i_dyskusja/Badanie_jednego_etapu_replikacji_(ang._One-Step_Growth)_faga_φOS10/Badania_pilot…")
- 14:29, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wyniki i dyskusja/Badanie jednego etapu replikacji (ang. One-Step Growth) faga φOS10/Badanie czasu latencji i wielkości wyrzutu fagowego (hist. | edytuj) [16 149 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} {{f|przed=2em|po=2em|'''5.7.2 Badanie czasu latencji i wielkości wyrzutu fagowego'''}} {{tab|40}}Po przeprowadzeniu procedury opisanej w Podrozdziale 4.19.3 ustalono, że MOI wynosi 1/283 (≈0,0035), czyli daleko poniżej wartości 1,0 – dzięki c…")
- 14:17, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wyniki i dyskusja/Badanie jednego etapu replikacji (ang. One-Step Growth) faga φOS10/Badania pilotażowe (hist. | edytuj) [983 bajty] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="5.7.1" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''5.7.1 Badania pilotażowe'''}} {{tab|40}}Procedura zastosowana w niniejszej pracy bazowała na metodyce Kropińskiego [{{Odnośnik|Kropiński, 2018|{{Indeks:PL Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10 J. Kamiński.pdf/lin…")
- 14:14, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wyniki i dyskusja/Analiza restrykcyjna izolatów DNA z badanych czystych kultur fagowych (hist. | edytuj) [2560 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="5.2" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''5.2 Analiza restrykcyjna izolatów DNA z badanych czystych kultur fagowych'''}} {{tab|40}}Z zawiesin cząstek fagowych Ł1, Ł2, Ł3, Ł5, Ł9, Ł10, Ł11, Ł12 oraz Ł13 izolowano DNA zgodnie z metodą opisaną w Podrozdziale 4.3. Otrzymane próbki bad…")
- 14:09, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wyniki i dyskusja/Analiza bioinformatyczna (hist. | edytuj) [1051 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="5.3" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''5.3 Analiza bioinformatyczna'''}} {{tab|40}}Identyfikacja ORFów w genomie bakteriofaga φOS10 została przeprowadzona z użyciem programu RAST [Decewicz & Radlińska, dane nieopublikowane], a ich adnotację wykonywano w ramach niniejszej pracy programami: Artemis, BLAST P oraz HMMER (Podrozdział…")
- 14:04, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wyniki i dyskusja/Analiza bioinformatyczna/Określenie przynależności taksonomicznej (hist. | edytuj) [1503 bajty] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} {{f|przed=2em|po=2em|'''5.3.3 Określenie przynależności taksonomicznej'''}} {{tab|40}}Uzyskany plik FASTA białek φOS10 zaimplementowano do programu VIRFAM (Podrozdziały 1.6.6 i 4.17.3), skąd otrzymano przyporządkowanie φOS10 do rodziny. Program VIRFAM przypisał φOS10 do rodziny ''Myoviridae'…")
- 13:55, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wyniki i dyskusja/Analiza bioinformatyczna/Analiza genomu bakteriofaga φOS10 (hist. | edytuj) [37 243 bajty] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} {{f|przed=2em|po=2em|'''5.3.1 Analiza genomu bakteriofaga φOS10'''}} {{tab|40}}Genom φOS10 miał długość 45 027 nt – wielkość ta jest typowa dla przedstawicieli rzędu ''Caudovirales'', jednak wśród innych dotychczas zsekwencjonowanych bakteriofagów infekujących bakterie z rodzaju ''Serratia'' jest…")
- 13:37, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wyniki i dyskusja/Analiza bioinformatyczna/Adnotacja otwartych ramek odczytu w genomie bakteriofaga φOS10 (hist. | edytuj) [22 335 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="5.3.2" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''5.3.2 Adnotacja otwartych ramek odczytu w genomie bakteriofaga φOS10'''}} {{tab|40}}Na drodze analizy bioinformatycznej z użyciem programów BLAST P oraz HMMER przeprowadzono adnotację ORFów, co umożliwiło poznanie potencjalnyc…")
- 13:24, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp (hist. | edytuj) [1207 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''1. Wstęp'''}}<section end="1" /> {{:Wstępna_charakterystyka_bakteriofaga_Serratia_φOS10/Wstęp/Informacje_ogólne_o_wirusach}} {{JustowanieKoniec2}} <noinclude> {{Cc-by-sa-3.0-tekst}} Kategoria:Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10 </noinclude>")
- 13:20, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Pochodzenie szczepów psychrofilnych Serratia spp. badanych w tej pracy (hist. | edytuj) [2826 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.8" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''1.8 Pochodzenie szczepów psychrofilnych Serratia spp. badanych w tej pracy'''}} {{tab|40}}Szczep wykorzystany w niniejszej pracy pochodzi z kolekcji szczepów wyizolowanych ze sztolni Gertruda, znajdującej się w Kopalni w Złotym Stoku (50°26'21.7"N 16°52'27…")
- 13:17, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Opis cyklu infekcyjnego bakteriofagów z rzędu Caudovirales (hist. | edytuj) [13 085 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.4" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''1.4 Opis cyklu infekcyjnego bakteriofagów z rzędu ''Caudovirales'''''}} {{tab|40}}Bakteriofagi z rzędu ''Caudovirales'', podobnie do innych wirusów, są obligatoryjnymi pasożytami i mogą się namnażać tylko wewnątrz komórek swojego gospodarza. Pierwszym etapem cyk…")
- 13:09, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Modularna struktura genomów bakteriofagów (hist. | edytuj) [1604 bajty] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.3" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''1.3 Modularna struktura genomów bakteriofagów'''}} {{tab|40}}Budowa modularna wiąże się z pojęciem "modułu funkcjonalnego" – tj. zgrupowania genów pod kontrolą wspólnego promotora, których produkty zazwyczaj biorą udział w tym samym procesie. Do funkcjonalnych modułów nale…")
- 13:06, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Informacje ogólne o wirusach (hist. | edytuj) [7759 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.1" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''1.1 Informacje ogólne o wirusach'''}} {{tab|40}}Wirusy to jednostki biologiczne reprodukujące się w komórkach organizmów żywych. Ich istnienie jest nierozłącznie związane z infekowanym organizmem (gospodarzem). Przyjmuje się, że każdy organizm może ulec infekcji wirusowej [{{Odnośnik|Baj, 2…")
- 12:59, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Informacje ogólne o wirusach/Wirusy infekujące bakterie – bakteriofagi (hist. | edytuj) [2970 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.1.1" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''1.1.1 Wirusy infekujące bakterie – bakteriofagi'''}} {{tab|40}}Bakteriofagi są najliczniejszymi jednostkami biologicznymi na Ziemi. Szacuje się, że ich całkowita liczebność sięga wartości 10<sup>31</sup> [{{Odnośnik|Suttle, 2005|{{Indeks:PL Wstę…")
- 12:57, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Informacje ogólne o wirusach/Klasyfikacja i taksonomia wirusów (hist. | edytuj) [8592 bajty] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.1.2" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''1.1.2 Klasyfikacja i taksonomia wirusów'''}} {{tab|40}}Przez klasyfikację wirusów rozumie się ich przyporządkowanie do właściwych taksonów. Instytucją koordynującą klasyfikację oraz nomenklaturę wirusów jest ustanowiony w roku 1966 Międzynarodowy Komite…")
- 12:50, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Cykl lizogenny, stan pseudolizogenii, infekcja chroniczna (hist. | edytuj) [972 bajty] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.5" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''1.5 Cykl lizogenny, stan pseudolizogenii, infekcja chroniczna'''}}<section end="1.5" /> {{:Wstępna_charakterystyka_bakteriofaga_Serratia_φOS10/Wstęp/Cykl_lizogenny,_stan_pseudolizogenii,_infekcja_chroniczna/Cykl_lizogenny}} {{:Wstępna_charakterystyka_bakteriofaga_Serratia_…")
- 12:46, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Cykl lizogenny, stan pseudolizogenii, infekcja chroniczna/Wpływ sekwencji profagowych na funkcjonowanie gospodarza (hist. | edytuj) [9584 bajty] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.5.4" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''1.5.4 Wpływ sekwencji profagowych na funkcjonowanie gospodarza'''}} Prawie połowa bakterii, których genomy zsekwencjonowano to lizogeny (46%) [{{Odnośnik|Touchon i in., 2016|{{Indeks:PL Wstępna cha…")
- 12:39, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Cykl lizogenny, stan pseudolizogenii, infekcja chroniczna/Stan pseudolizogenii (hist. | edytuj) [1591 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.5.2" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''1.5.2 Stan pseudolizogenii'''}} Wszystkie bakteriofagi; niezależnie czy zjadliwe, czy łagodne; mogą wejść w stan pseudolizogenii [{{Odnośnik|Łoś & Węgrzyn, 2012|{{Indeks:PL Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10 J.…")
- 12:36, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Cykl lizogenny, stan pseudolizogenii, infekcja chroniczna/Infekcja chroniczna (hist. | edytuj) [800 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.5.3" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''1.5.3 Infekcja chroniczna'''}} Niektóre fagi wirulentne i łagodne mogą powodować infekcję chroniczną, w której w zainfekowanych komórkach wirusowe cząstki potomne są stale wytwarzane i opuszczają ją nie powodując lizy. Mechanizm ten charakter…")
- 12:33, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Cykl lizogenny, stan pseudolizogenii, infekcja chroniczna/Cykl lizogenny (hist. | edytuj) [6278 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.5.1" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''1.5.1 Cykl lizogenny'''}} {{tab|40}}Opisany w Podrozdziale 1.4 przebieg cyklu infekcyjnego jest uniwersalny dla wszystkich bakter…")
- 12:26, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Budowa wirionów bakteriofagów z rzędu Caudovirales (hist. | edytuj) [2378 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.2" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''1.2 Budowa wirionów bakteriofagów z rzędu ''Caudovirales'''''}} {{tab|40}}Bakteriofagi z rzędu ''Caudovirales'' mają budowę złożoną (Ryciny 4,5,6). Ich kapsydy składają się z ikozaedralnej główki i ogonka, który zakończony może być płytką podstawową (ang. ''ba…")
- 12:21, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Bakterie rodzaju Serratia i infekujące je bakteriofagi (hist. | edytuj) [7898 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.7" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''1.7 Bakterie rodzaju ''Serratia'' i infekujące je bakteriofagi'''}} {{tab|40}}Podczas doświadczeń wykonywanych na potrzeby niniejszej pracy wykorzystano jako gospodarzy dwa szczepy z rodzaju ''Serratia'' sp.: OS10 i W54. ''Serratia'' to gramujemne i nieprzetrwalnikujące pał…")
- 12:07, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Analiza bioinformatyczna genomów fagowych (hist. | edytuj) [5128 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.6" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''1.6 Analiza bioinformatyczna genomów fagowych'''}} {{tab|40}}Postęp w genomice wiążący się z udoskonaleniem technik sekwencjonowania klasów nukleinowych i białek (oraz spadku cen usług związanych z sekwencjonowaniem) przełożył się na powstanie ogromnych ilości danych w postaci…")
- 11:58, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Analiza bioinformatyczna genomów fagowych/Virfam (hist. | edytuj) [2393 bajty] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.6.5" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''1.6.5 Virfam'''}} {{tab|40}}Virfam jest programem służącym do określania przynależności do rodziny taksonomicznej badanych bakteriofagów ogonkowych z rzędu ''Caudovirales''. Przyporządkowanie do określonej rodziny ma miejsce w oparciu o analizę bioinformatyczną sekwencji…")
- 11:56, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Analiza bioinformatyczna genomów fagowych/Serial Cloner (hist. | edytuj) [1206 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.6.6" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''1.6.6. Serial Cloner'''}} {{tab|40}}Serial Cloner (wersja 2.6.1) jest darmowym oprogramowaniem służącym do analizy sekwencji nukleotydowych, m. in: wizualizacji genomu, identyfikacji potencjalnych ORFów, tłumaczenia sekwencji nukleotydowej na sekwencję aminokwasow…")
- 11:54, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Analiza bioinformatyczna genomów fagowych/RAST (hist. | edytuj) [1064 bajty] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.6.1" /> {{f|po=1em|'''1.6.1 RAST'''}} {{tab|40}}Program RAST (ang. '''''R'''apid '''A'''nnotations using '''S'''ubsystems '''T'''echnology)'' wykorzystywany jest do wykrywania w sekwencji nukleotydowej potencjalnych otwartych ramek odczytu (ang. '''''O'''pen '''R'''eading '''F'''rame, ORF'') w oparciu o występując…")
- 11:51, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Analiza bioinformatyczna genomów fagowych/HMMER (hist. | edytuj) [972 bajty] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.6.4" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''1.6.4 HMMER'''}} {{tab|40}}Jest to program wyszukujący ukryte modele Markowa (ang. '''HMM''' – '''''H'''idden '''M'''arkow '''M'''odels'') w sekwencji aminokwasowej potencjalnego produktu białkowego, co umożliwia wykrycie potencjalnych domen funkcjonalnych [{{Odnośnik|Rekapalli…")
- 11:48, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Analiza bioinformatyczna genomów fagowych/BLAST (hist. | edytuj) [4491 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.6.3" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''1.6.3 BLAST'''}} {{tab|40}}BLAST (ang. '''''B'''asic '''L'''ocal '''A'''lignment '''S'''earch '''T'''ool'') jest programem, który w oparciu o algorytm Needleman’a-Wunsch’a porównuje zaimplementowaną przez użytkownika sekwencję nukleotydową lub białkową (sekwencja zapytani…")
- 11:45, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Analiza bioinformatyczna genomów fagowych/Artemis (hist. | edytuj) [1053 bajty] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.6.2" /> {{f|po=1em|'''1.6.2 Artemis'''}} {{tab|40}}Artemis jest programem funkcjonującym w oparciu o platformę Java. Dostosowany jest do użytku domowego i nie wymaga zakupu licencji na użytkowanie. Wykorzystywany jest w szczególności do adnotacji genomów prokariotycznych oraz genomów niższych eukariontó…")
- 11:42, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Wstęp/Analiza bioinformatyczna genomów fagowych/ARAGORN (hist. | edytuj) [959 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="1.6.7" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''1.6.7. ARAGORN'''}} {{tab|40}}Program ARAGORN służy do detekcji genów kodujących tRNA (ang. '''''t'''ransfer '''RNA''''') oraz tmRNA (ang. '''''t'''ransfer-'''m'''essenger '''RNA''''') w zaimplementowanych sekwencjach nukleotydowych. Wyszukiwanie sekwencji genów kodu…")
- 11:09, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Podziękowania (hist. | edytuj) [2244 bajty] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} {{f|po=2.5em|'''Podziękowania'''}} {{tab|40}}W tym miejscu chciałbym podziękować wszystkim osobom, które wspierały mnie podczas pisania mojej pracy magisterskiej. W pierwszej kolejności chciałbym złożyć serdeczne podziękowania mojej Pani Promotor dr. hab. Monice Radlińskiej, która zawsze wspierała mnie merytorycznie i uczyła laboratoryjnego fachu już na st…")
- 11:08, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Podsumowanie (hist. | edytuj) [1970 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} {{f|przed=2em|po=2em|'''6. Podsumowanie'''}} {{tab|40}}Zamierzeniem niniejszej pracy była wstępna charakterystyka bakteriofaga φOS10 namnożonego w bakterii ''Serratia'' sp. OS10 pochodzącej z nieczynnej kopalni w Złotym Stoku. Udało się ustalić rodzaj materiału genetycznego bakteriofaga (dsDNA). Genom poddano sekwencjonowaniu, a uzyskaną sekwencję nukleotydową p…")
- 10:28, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Metody (hist. | edytuj) [3170 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="4" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''4. Metody'''}}<section end="4" /> {{/Określanie_miana_zawiesiny_fagowej_metodą_nakropleń_i_metodą_testu_pełnoszalkowego}} {{/Izolacja_cząstek_fagowych}} {{/Izolacja_DNA_fagowego}} {{/Trawienia_enzymami_restrykcyjnymi}} {{/Elektroforeza_DNA_w_żelu_agarozowym}} {{/Reizolacja_fragmentów_DNA_z_żelu_agarozowego}} {{/Wypełnianie_je…")
- 09:57, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Metody/Wypełnianie jednoniciowych końców DNA z użyciem Polimerazy faga T4 (hist. | edytuj) [850 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="4.8" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''4.8 Wypełnianie jednoniciowych końców DNA z użyciem Polimerazy faga T4'''}} {{tab|40}}Do próbki dodawano: (i) bufor LB o stężeniu 10x do końcowego stężenia 1x; (ii) roztwór dNTP-ów do uzyskania końcowego stężenia 0,1 mM; (iii) polimerazę faga T4 w…")
- 09:54, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Metody/Wypełnianie jednoniciowych końców DNA z użyciem Fragmentu Klenowa (hist. | edytuj) [888 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="4.7" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''4.7 Wypełnianie jednoniciowych końców DNA z użyciem Fragmentu Klenowa'''}} Do próbki dodawano: (i) bufor LB o stężeniu 10x do końcowego stężenia 1x; (ii) roztwór dNTP-ów do uzyskania końcowego stężenia 0,05 mM; (iii) fragment Klen…")
- 09:52, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Metody/Trawienia enzymami restrykcyjnymi (hist. | edytuj) [576 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="4.4" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''4.4 Trawienia enzymami restrykcyjnymi'''}} {{tab|40}}Trawienia DNA enzymami restrykcyjnymi przeprowadzano w oparciu o wytyczne wskazane przez producenta, uwzględniające odpowiednie bufory i temperatury inkubacji. Inkubacje trwały od 1 do 3 godzin. Wykorzystywano 1 jednostkę enzymu na 10 ng D…")
- 09:50, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Metody/Transformacja DNA do bakterii chemokompetentnych (hist. | edytuj) [1651 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="4.12" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''4.12 Transformacja DNA do bakterii chemokompetentnych'''}} {{tab|40}}Próbkę 100 µl bakterii kompetentnych (Podrozdział 4.11) rozmrażano, utrzymując w temperaturze lodu. Dodawano 10 µl mieszaniny ligacyjnej (Podrozdział 4.9) i mieszano z użyciem pipety automatycznej. Próbki i…")
- 09:47, 13 sty 2023 Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10/Metody/Sekwencjonowanie (hist. | edytuj) [399 bajtów] Persino (dyskusja | edycje) (Utworzono nową stronę "{{JustowanieStart2}} <section begin="4.16" /> {{f|przed=2em|po=2em|'''4.16 Sekwencjonowanie'''}} {{tab|40}}Sekwencjonowanie wykonywano w ramach usługi zewnętrznej zleconej Pracowni Sekwencjonowania DNA IBB PAN. <section end="4.16" /> {{JustowanieKoniec2}} <noinclude> {{Cc-by-sa-3.0-tekst}} Kategoria:Wstępna charakterystyka bakteriofaga Serratia φOS10 </noinclude>")